mmore500/automap-soro:latest

$ singularity pull shub://mmore500/automap-soro:latest

Singularity Recipe

################################################################################
# Basic bootstrap definition to build Ubuntu container from Docker container
################################################################################

Bootstrap:docker
From:ubuntu:latest

%labels
Maintainer Matthew Andres Moreno
Version 0.0.0

################################################################################
# Copy any necessary files into the container
################################################################################
%files
. /opt/automap-soro

%post
################################################################################
# Install additional packages
################################################################################
apt-get update

apt-get install -y libqt4-dev qt4-qmake libqwt-dev freeglut3-dev zlib1g-dev

apt-get install -y python
apt-get install -y python-setuptools python-dev build-essential python-pip
export LC_ALL=C
pip install scipy networkx==1.11

apt-get install -y git
git clone https://github.com/skriegman/evosoro.git /opt/evosoro
cd /opt/evosoro/evosoro/_voxcad/
./rebuild_everything.sh

cd Voxelyze
make
make installusr
cd ../voxelyzeMain/
make

chmod 777 -R /opt

################################################################################
# Create directories to enable access to common HPCC mount points
################################################################################
mkdir -p /mnt/home
mkdir -p /mnt/research
mkdir -p /mnt/dfs17
mkdir -p /mnt/ffs17
mkdir -p /mnt/local
mkdir -p /mnt/ls15
mkdir -p /opt/software
mkdir -p /mnt/scratch

################################################################################
# Run the user's login shell, or a user specified command
################################################################################
%runscript
exec "$@"

Collection

• Name: mmore500/automap-soro
• License: MIT License

Metrics

Feedback

Was this page helpful?

Glad to hear it! Please tell us how we can improve.

Sorry to hear that. Please tell us how we can improve.