ddnguyen2/Centos7:conda

$ singularity pull shub://ddnguyen2/Centos7:conda

Singularity Recipe

################################################################################
# Basic bootstrap definition to build CentOS 7 container from Docker container
################################################################################

BootStrap: docker
From: centos:latest
 
################################################################################
# Copy any necessary files into the container
################################################################################
%files
./etc/profile.d/z_container_prompt.sh  /etc/profile.d/z_container_prompt.sh
./etc/profile.d/z_container_prompt.csh /etc/profile.d/z_container_prompt.csh
 
%post
################################################################################
# Make sure the umask is 0022
################################################################################
umask 0022

################################################################################
# Install additional login shells for users that need them
################################################################################
yum -y install tcsh ksh zsh

################################################################################
# Install additional packages
################################################################################
yum -y install vim
yum -y install libXrender-devel
yum -y install wget
yum -y install bzip2
wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh -f -b -p /home/anaconda
export PATH="/home/anaconda/bin:$PATH"
################################################################################
# Install PIP from EPEL and upgrade it to the latest version
################################################################################
yum -y install epel-release
# yum -y install python34-pip python-pip
# pip  install --upgrade pip
# pip3 install --upgrade pip
# pip  install --upgrade virtualenv
conda update -y conda
pip install --upgrade tensorflow
pip install keras
conda update -y conda
################################################################################
# Create directories to enable access to common HPCC mount points
################################################################################
mkdir /boot
mkdir /cvmfs
mkdir -p /mnt/home
mkdir -p /mnt/research
mkdir -p /mnt/dfs17
mkdir -p /mnt/ffs17
mkdir -p /mnt/local
mkdir -p /mnt/ls15
mkdir -p /opt/software

################################################################################
# Run the user's login shell, or a user specified command
################################################################################
%runscript
SHELL="$(getent passwd $USER | awk -F: '{print $NF}')"
SHELL=${SHELL:-/bin/bash}
if [[ "$@" == "" ]]; then 
  exec env -i TERM="$TERM" HOME="$HOME" $SHELL -l
else
  exec env -i TERM="$TERM" HOME="$HOME" $@
fi

Collection

• Name: ddnguyen2/Centos7
• License: None

Metrics

Feedback

Was this page helpful?

Glad to hear it! Please tell us how we can improve.

Sorry to hear that. Please tell us how we can improve.